《超次元学院2》经过一学期的相处，学习小组的成员们建立了深厚的友谊。假期过后，小伙伴们回到学校开始了新学期的生活。而全国大赛预选赛也近在眼前，只有取得了全国大赛预选赛的胜利才有资格代表超次元学院参加全国大赛。正当学习小组的成员们为全国大赛预选赛努力时，却来了几位不速之客……
