《黑蔷薇2》在警务课工作的女警神木（贯地谷饰），一次偶然机会被派去有独居老人尸体的现场。虽然验尸官检查后以病死处理，但神木怀疑是他杀并不认同这个验尸结果。另一边，和神木在同一辖区警署的刑事课主任折原（岸谷饰）也遇到了类似的案件。二人再次合作，在找出各个案件的共同点的同时，逐步深入挖掘出警察内部的黑暗面。
